1、在使用前，一定要注意色譜柱的儲存液與要分析樣品的流動相是否互溶。在反相色譜中，如用濃度的鹽或緩沖液作洗脫劑，應用 10 ％左右的低濃度的有機相洗脫劑過渡一下，否則緩沖液中的鹽在濃度的有機相中容易析出，堵塞色譜柱。
  2、流動相中所使用的各種有機溶劑要盡可能使用色譜純，配流動相的水盡量是純水或玻璃器皿的雙蒸水。如果將所配得流動相再經(jīng)過 0.45μm 的濾膜過濾一次則較好，尤其是含鹽的流動相。另外，裝流動相的容器和色譜系統(tǒng)中的在線過濾器等裝置應該定期清洗或更換。當必須要在 PH 值適用范圍的邊界條件下使用色譜柱時，每次使用結(jié)束后立即用適合于色譜柱儲存并與所使用的流動相互溶的溶劑清洗，并*置換掉原來所使用的流動相。

  3、樣品也要盡可能清潔，可選用樣品過濾器或樣品預處理柱（SPE）對樣品進行預處理；若樣品不便處理，要使用保護柱。在用正相色譜法分析樣品時，的溶劑和樣品應嚴格脫水。